Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbbp8Q80YR6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbbp8Q80YR6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms