Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnupnQ80W37 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SnupnQ80W37 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms