Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmcc2Q80W04 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms