Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc1Q80VQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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