Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TwistnbQ78WZ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TwistnbQ78WZ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms