Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmeff1Q6PFE7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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