Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtifQ6PEE2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtifQ6PEE2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms