Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Soga3Q6NZL0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Soga3Q6NZL0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms