Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Szrd1Q6NXN1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms