Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Asic1Q6NXK8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Asic1Q6NXK8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms