Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep78Q6IRU7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep78Q6IRU7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms