Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tpm4Q6IRU2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tpm4Q6IRU2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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