Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arhgap20Q6IFT4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms