Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT9

Nomo1, Nodal modulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nomo1Q6GQT9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nomo1Q6GQT9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms