Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctnna3Q65CL1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms