Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Zfp248Q640N4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zfp248Q640N4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Zfp248Q640N4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zfp248Q640N4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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