Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic2Q62520 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zic2Q62520 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms