Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SypQ62277 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SypQ62277 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SypQ62277 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SypQ62277 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms