Protein–RNA interactions for Protein: Q61656

Ddx5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx5Q61656 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx5Q61656 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms