Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgaeQ60677 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgaeQ60677 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms