Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sin3aQ60520 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sin3aQ60520 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sin3aQ60520 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms