Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cpa6Q5U901 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpa6Q5U901 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms