Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc42Q5SV66 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc42Q5SV66 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms