Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tns3Q5SSZ5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms