Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc185Q3V118 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms