Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrrc43Q3V0L5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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