Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk4Q3V016 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hipk4Q3V016 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms