Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkain3Q3URJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms