Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf224Q3UIW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf224Q3UIW8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms