Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TchpQ3TVW5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms