Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt2Q3TTY5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt2Q3TTY5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms