Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TTJ4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms