Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col19a1Q0VF58 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col19a1Q0VF58 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col19a1Q0VF58 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Col19a1Q0VF58 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col19a1Q0VF58 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms