Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssrp1Q08943 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms