Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NrepQ07475 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NrepQ07475 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms