Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Caprin2Q05A80 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms