Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rcn1Q05186 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms