Protein–RNA interactions for Protein: Q02862

Csn1s2a, Alpha-S2-casein-like A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s2aQ02862 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s2aQ02862 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csn1s2aQ02862 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms