Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrkcqQ02111 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms