Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GabpaQ00422 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GabpaQ00422 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms