Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabpb1Q00420 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms