Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RptnP97347 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RptnP97347 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RptnP97347 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RptnP97347 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RptnP97347 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RptnP97347 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RptnP97347 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RptnP97347 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RptnP97347 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RptnP97347 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RptnP97347 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms