Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tbx6P70327 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tbx6P70327 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms