Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif1P70284 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms