Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sycp3P70281 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sycp3P70281 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms