Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rad54lP70270 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rad54lP70270 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms