Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms