Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rrp1P56183 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rrp1P56183 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms