Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sh3bp1P55194 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp1P55194 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms