Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1cP52432 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1cP52432 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms